某醫院決定投資一億余元，興建一幢現代化的住院綜合樓。其中土建工程采用公開招標的方式選定施工單位，但招標文件對省內的投標人與省外的投標人提出了不同的要求，也明確了投標保證金的數額。該院委托某建筑事務所為該項工程編制標底。2000年10月6日招標公告發出后，共有A、B、C、D、E、F等6家省內的建筑單位參加了投標。投標文件規定2000年10月30日為提交投標文件的截止時間，2000年月11月13日舉行開標會。其中，E單位在2000年10月30日提交了投標文件，但2000年11月1日才提交投標保證金。開標會由該省建委主持。結果，其所編制的標底高達6200多萬元，與其中的A、B、C、D等4個投標人的投標報價均在5200萬元以下，與標底相差1000萬余元，引起了投標人的異議。這4家投標單位向該省建委投訴，稱某建筑事務所擅自更改招標文件中的有關規定，多計漏算多項材料價格。為此，該院請求省建委對原標底進行復核。2001年1月28日，被指定進行標底復核的省建設工程造價總站（以下簡稱總站）拿出了復核報告，證明某建筑事務所在編制標底的過程中確實存在這4家投標單位所提出的問題，復核標底額與原標底額相差近1000萬元。
由于述問題久拖不決，導致中標書在開標三個月后一直未能發出。為了能早日開工，該院在獲得了省建委的同意后，更改了中標金額和工程結算方式，確定某省公司為中標單位。
問題：
（1）上述招標程序中，有哪些不妥之處？請說明理由。
（2）E單位的投標文件應當如何處理？為什么？
（3）對D單位撤回投標文件的要求應當如何處理？為什么？
（4）問題久拖不決后，某醫院能否要求重新招標？為什么？
（5）如果重新招標，給投標人造成的損失能否要求該醫院賠償？為什么？